材料与方法
一、标本来源
二、肝癌大样本数据的获取
三、 细胞系和细胞培养
四、蛋白免疫印迹法
五、免疫组织化学染色(免疫组化)
六、实时定量PCR
七、统计学处理
结果
一、TCGA数据库的基因芯片及临床数据分析
二、肝癌组织和肝癌旁组织分析结果
表1 58例肝癌组织STX6 mRNA表达水平与患者临床病理参数的关系[例(%)] |
| 项 目 | STX6 mRNA | χ2值 | P 值 | |
|---|---|---|---|---|
| 高表达(30例) | 低表达 (28例) | |||
| 性别 | - | 0.354a | ||
| 男 | 26(87) | 27(96) | ||
| 女 | 4(13) | 1(4) | ||
| 年龄 | 2.421 | 0.120 | ||
| ≥49岁 | 21(70) | 14(50) | ||
| < 49岁 | 9(30) | 14(50) | ||
| 病毒性肝炎 | - | 0.671a | ||
| HBV/HCV阴性 | 4(13) | 2(7) | ||
| HBV/HCV阳性 | 26(87) | 26(93) | ||
| 肿瘤分化程度 | -2.898 | 0.004 | ||
| 高分化 | 6(20) | 12(43) | ||
| 中分化 | 15(50) | 16(57) | ||
| 低分化 | 9(30) | 0(0) | ||
| 肿瘤大小 | 4.661 | 0.031 | ||
| ≥5 cm | 17(57) | 8(29) | ||
| < 5 cm | 13(43) | 20(71) | ||
| Child-Pugh分级 | - | 0.929a | ||
| A | 27(90) | 25(89) | ||
| B | 3(10) | 3(11) | ||
| C | 0(0) | 0(0) | ||
| AJCC肿瘤分期 | -2.546 | 0.011 | ||
| Ⅰ | 7(23) | 15(54) | ||
| Ⅱ | 10(33) | 8(29) | ||
| Ⅲ | 13(43) | 5(18) | ||
注:a Fisher确切概率法 |
三、STX6的表达与肝癌患者的预后密切相关
表2 肝癌患者总生存率的影响因素分析 |
| 项 目 | 单因素分析 | 多因素分析 | ||
|---|---|---|---|---|
| HR(95%CI) | P值 | HR(95%CI) | P值 | |
| 性别 | ||||
| 男 | 0.989(0.300 ~ 3.256) | 0.985 | - | - |
| 女 | 参照组 | |||
| 年龄 | ||||
| ≥49岁 | 0.767(0.381 ~ 1.544) | 0.458 | - | - |
| <49岁 | 参照组 | |||
| 病毒性肝炎 | ||||
| HBV/HCV阴性 | 5.158(0.703 ~ 37.834) | 0.107 | - | - |
| HBV/HCV阳性 | 参照组 | |||
| 肿瘤分化程度 | 0.001 | - | - | |
| 高分化 | 3.380(1.258 ~ 9.083) | |||
| 中分化 | 9.258(2.923 ~ 29.323) | |||
| 低分化 | 参照组 | |||
| 肿瘤大小 | ||||
| ≥5 cm | 2.579(1.191 ~ 5.584) | |||
| <5 cm | 参照组 | |||
| Child-Pugh分级 | ||||
| A | 1.678(0.645 ~ 4.366) | 0.289 | - | - |
| B | 参照组 | |||
| AJCC肿瘤分期 | < 0.001 | < 0.001 | ||
| Ⅰ | 3.025(1.125 ~ 8.137) | 5.454(1.825 ~ 16.297) | 0.002 | |
| Ⅱ | 8.054(3.224~20.124) | 8.083(3.151 ~ 20.732) | < 0.001 | |
| Ⅲ | 参照组 | 参照组 | ||
| STX6 | ||||
| 低表达 | 2.999(1.458 ~ 6.169) | 0.003 | 3.872(1.641 ~ 9.140) | 0.002 |
| 高表达 | 参照组 | 参照组 | ||