1 材料与方法
1.1 生物信息学分析
1.1.1 转录调控网络分析
1.1.2 生存分析与信号通路分析
1.1.3 GSE184880数据集分析
1.2 临床病理特征及免疫组化检测
1.2.1 病理样本和临床数据收集
1.2.2 高级别浆液性卵巢癌和卵巢透明细胞癌中CLEC7A和PD-L1表达的免疫组织化学染色检测
1.3 体外细胞实验
1.3.1 细胞分组与培养
1.3.2 实时荧光定量PCR检测CLEC7A的mRNA表达水平
1.3.3 蛋白免疫印迹法检测CLEC7A及相关通路的蛋白表达
1.3.4 细胞增殖和凋亡实验
1.3.5 流式细胞术检测PD-L1的表达
1.4 小鼠荷瘤实验
1.5 统计学方法
2 结果
2.1 转录调控网络分析确定CLEC7A为高级别浆液性卵巢癌中与PD-1/PD-L1相关的基因
图1 转录调控网络分析确定CLEC7A为高级别浆液性卵巢癌中与PD-1/PD-L1相关的基因注:A为高级别浆液性卵巢癌和卵巢透明细胞癌中,乳腺癌易感基因BRCA1突变频率的差异;B为检测高级别浆液性卵巢癌和卵巢透明细胞癌中,PD-L1免疫组织化学染色得分比较差异有统计学意义(P < 0.001);C为在TCGA-OV数据集中,鉴定出高级别浆液性卵巢癌与其他亚型卵巢癌中的差异表达基因,使用转录调控网络分析,确定调控免疫相关基因的PD-1/PD-L1通路相关基因;D为使用MRA算法对免疫相关基因的调节能力进行排序;E、F为在TCGA-OV数据集中,CLEC7A、FOXP3基因表达水平与患者总体生存率之间的相关性;G、H为在TCGA-OV数据集中,CLEC7A基因在转归结局为生存和死亡的患者之间的表达差异,FOXP3基因在转归结局为生存和死亡的患者之间的表达差异;I为免疫组化(En Vision两步法染色)检测70例HGSOC与对应的癌旁组织中CLEC7A在蛋白水平的表达,NON为癌旁正常组织;组间比较,ns P > 0.05,**P < 0.01,***P < 0.001。 Figure 1 Transcriptional regulatory network analysis identifies CLEC7A as a gene associated with PD-1/PD-L1 in HGSOC |
2.2 CLEC7A促进高级别浆液性卵巢癌细胞的增殖,抑制其凋亡
图2 CLEC7A促进高级别浆液性卵巢癌细胞的增殖并抑制其凋亡注:A为OVCAR-3细胞分别转入CON、CLEC7A shRNA载体48 h后,使用蛋白免疫印迹法检测CLEC7A在蛋白水平的表达结果;B为使用RT-qPCR检测CON、CLEC7A shRNA1细胞中CLEC7A在mRNA水平的表达结果;C为OVCAR-3细胞分别转入CON、CLEC7A shRNA1载体48 h后,使用Annexin V APC/PI双染法检测细胞凋亡变化的结果;D为使用JC-10染色法检测OVCAR-3 CON、CLEC7A shRNA1细胞凋亡变化的结果;E为使用CCK-8法检测OVCAR-3 CON、CLEC7A shRNA1细胞增殖变化的结果;F为分别取1×107个OVCAR-3 CON组、CLEC7A shRNA1组细胞注射入裸鼠皮下,21 d后两组小鼠肿瘤体积变化的结果;组间比较,***P < 0.001。 Figure 2 High expression promoted by CLEC7A is crucial for the proliferation and inhibition of apoptosis in HGSOC tumor cells |
2.3 CLEC7A通过JAK/STAT3通路激活PD-L1表达
图3 CLEC7A通过JAK/STAT3通路激活了PD-L1的表达注:A为使用1×10-6 mol/L的奥拉帕尼在不同时间点处理OVCAR-3细胞系,并使用蛋白免疫印迹法检测CLEC7A在蛋白水平的表达;B为TCGA-OV数据集中,检测HGSOC中CLEC7A高表达组的信号通路的富集;C为使用GSEA检测STAT3信号通路的富集;D为使用蛋白免疫印迹法检测OVCAR-3 CON、CLEC7A shRNA1细胞中JAK、STAT3磷酸化的变化;E为OVCAR-3细胞转入CON与CLEC7A过表达载体48 h后,使用RT-qPCR检测CLEC7A在mRNA水平的变化;F为OVCAR-3 CLEC7A过表达使用STAT3抑制剂Stattic处理48 h后,使用流式细胞仪检测PD-L1的表达;G为CCK-8法检测CLEC7A过表达与OVCAR-3细胞系增殖能力的关系;H为免疫组化(En Vision两步法染色)检测HGSOC石蜡标本中CLEC7A与PD-L1表达的相关性;组间比较,***P < 0.001。 Figure 3 CLEC7A activates the expression of PD-L1 through the JAK/STAT3 signaling pathway |
2.4 高级别浆液性卵巢癌中CLEC7A的高表达抑制T细胞的增殖
图4 高级别浆液性卵巢癌中CLEC7A的高表达抑制了T细胞的增殖注:A为在GSE184880数据集中,比较CLEC7A低表达组和CLEC7A高表达组样本之间免疫细胞比例的变化;B为分别取1×107个OVCAR-3 CON、CLEC7A shRNA1细胞注射入裸鼠皮下,14 d后检测原位肿瘤中MDSC的变化;C为检测OVCAR-3 CON、CLEC7A shRNA1原位肿瘤中,CD8+ T细胞比例的变化;D为将CON与CLEC7A中髓系来源的抑制性细胞(MDSC)分别与T细胞共培养后,使用羧基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE)检测T细胞增殖的改变;组间比较,* P < 0.05,***P < 0.001。 Figure 4 High expression of CLEC7A in HGSOC inhibits the proliferation of T cells |