江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统分析
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摘要: 目的:了解江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统。方法:收集42份血清抗-HIV阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式 PCR法扩增env及 pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,比对确定基因亚型,分析不同途径感染者的基因亚型,构建系统进化树。结果:42份标本中,扩增出env及pol基因片段27份(64%);共发现5种 HIV-1亚型,其中 CRF01-AE亚型 19份、C亚型 2份、B亚型3份、CRF08-BC 2份、G亚型1份。经静脉药瘾感染者基因型多为CRF01-AE亚型;经性接触感染者HIV-1基因亚型包括检出的全部亚型,经性接触及吸毒感染者基因亚型均为CRF01-AE亚型。两基因构建系统进化树高度一致,主要有CRF_01AE、B_07、G、C和CRF_08BC 5种HIV亚型在流行,而以CRF_01AE为主要流行株。结论:江苏省 HIV-1基因亚型至少有5种,其中 CRF01-AE为主要亚型。
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